Proteiineja muokataan verkkopelissä
13.5.2008
Washingtonin yliopiston tutkijat ovat kehittäneet avoimen verkkopelin, jossa pelaajat suunnittelevat uusia proteiinirakenteita. Foldit-pelissä tutustutaan proteiinin rakenteeseen ja muokataan sitä esimerkiksi kolmiulotteisesti kääntelemällä ja vetysidoksia luomalla.
Tutkijoiden toiveissa pelaajat voitaisiin lopulta haastaa suunnittelemaan esimerkiksi HI-viruksen tai malarialoisen toiminnan estäviä proteiineja. Suunnittelun tuloksena voisi syntyä myös myrkyllistä jätettä hajottavia tai ilman hiilidioksidia sitovia entsyymejä.
Uusien proteiinirakenteiden kehittely tietokoneella on perinteisesti ollut vaivalloista, kun ohjelmat ovat kartoittaneet kaikkia teoriassa mahdollisia rakenteita - myös toimimattomia sellaisia.
Proteiinit koostuvat aminohappoketjuista, jotka ovat järjestyneet monimutkaisiksi rakenteiksi esimerkiksi vetysidoksien ja rikkisiltojen avulla. Rakenteestaan riippuen proteiinit muun muassa muodostavat soluja, säätelevät geenejä, nopeuttavat kemiallisia reaktioita ja mahdollistavat immuunijärjestelmän toiminnan.