Ensimmäinen puun perimä selvitetty
15.9.2006
Tutkijat ovat selvittäneet ensimmäisen puulajin, jättipoppelin, perimän. Nelivuotiseen laajaan tutkimusyhteistyötyöhön osallistui 34 tutkimuslaitosta eri puolilta maailmaa. Helsingin yliopistosta mukana olivat Yrjö Helariutan ja Jaakko Kangasjärven
tutkimusryhmät.
Jättipoppeli on vasta kolmas kasvilaji, jonka perimän koostumus on selvitetty. Kaksi aiempaa ovat lituruoho ja riisi.
Jättipoppelin perimä koostuu noin 500 miljoonasta emäsparista, jotka jakaantuvat 19 kromosomiin. Tutkijat tunnistivat yli 45 000 mahdollisesti proteiinia koodaavaa geeniä, mikä on enemmän kuin millään aiemmin sekvensoidulla organismilla. Suurimmalle osalle poppelin
proteiineja koodaavista geeneistä löytyy vastine lituruohon perimästä, mutta yli 10 prosenttia geeneistä jäi ilman vastinetta. Tutkijat uskovat, että poppelille ominaiset geenit vaikuttavat puille tyypillisten ominaisuuksien kehittymiseen.
Lituruohoon verrattuna poppelissa löytyy runsaasti geenejä, jotka liittyvät sairauksien ja hyönteisten vastustuskykyyn, kasvusolukkojen kehitykseen, aineenvaihduntatuotteiden tai ravinteiden kuljetukseen sekä soluseinän biosynteesiin.
Suomalaistutkijoiden löytämät geenit sisältävät valmistusohjeet sytokiniini- ja etyleeni-kasvihormonien tuottoon. Nämä ovat merkittäviä puiden kehityksen
säätelijöitä. Sytokiinit säätelevät puun kehitykselle tärkeiden solujen jakautumista ja erilaistumista. Etyleeni taas säätelee puille ominaisia piirteitä, kuten vetopuun kehitystä ja itämislevon alkamista. Poppelilla
onkin lituruohoa enemmän näiden hormonien signalointiin liittyviä geenejä.
Ensimmäisen puulajin perimän selvitys mahdollistaa puumaisten ja ruohovartisten kasvilajien perimän vertailun ja edistää esimerkiksi puun kehityksen, aineiden kuljetuksen, latvuston muodostuksen ja tautien
vastustuskyvyn tutkimusta.
Projekti on osa USA:n energiaministeriön pyrkimystä lisätä biopolttoaineiden tuotannon tutkimusta. Tuloksista toivotaan myös hyötyä metsänjalostukselle, ja
sitä kautta puunjalostusteollisuudelle. Tieto geeneistä auttaa puiden jalostamisessa erilaisia tarkoituksia varten.