Tyypitysmenetelmä elintarvikkeita saastuttaville bakteereille
1.7.2008
Listeria- ja klostridikontaminaation lähde on nyt entistä helpompi selvittää. Helsingin yliopiston tutkija Riikka Keto-Timosen väitöskirjassa kehitettiin uutta menetelmää muun muassa elintarvikkeita saastuttavien bakteerien geneettiseen tyypittämiseen.
DNA-pohjaiset genotyypitysmenetelmät ovat tärkeitä työkaluja bakteerien tunnistamisessa ja sukulaisuussuhteiden selvittämisessä. Menetelmien soveltuvuudessa eri bakteerilajeille sekä erilaisiin tutkimustarkoituksiin on kuitenkin eroja. Keto-Timonen selvitti tutkimuksessaan amplified fragment length polymorphism (AFLP) -menetelmän soveltuvuutta elintarvikevälitteisten tautia-aiheuttavien bakteerien Listeria monocytogeneksen, Clostridium botulinumin ja Clostridium perfringensin geneettiseen tyypittämiseen.
Lisäksi tutkimuksessa selvitettiin elintarvikkeiden tuotantoympäristössä pitkäkestoisen kontaminaation aiheuttavien ja satunnaisesti esiintyvien listeriakantojen välisiä eroja.
Väitöstutkimuksessa kehitettiin toistettava, nopea ja helppokäyttöinen menetelmä, jota voidaan käyttää eri listeria- ja klostridilajien tunnistamisessa. Uuden menetelmän avulla tulokset voidaan kerätä tietokantoihin, jotka ovat hyödynnettävissä epidemiologisissa tutkimuksissa, elintarviketeollisuuden kontaminaatioreittien selvittämisessä, ruokamyrkytysepidemia selvityksissä ja listeria- ja klostridilajien tunnistamisessa.
Väitöstyössä tutkittiin L. monocytogeneksen kontaminaatioreittejä eineksiä valmistavassa elintarvikelaitoksessa. Tutkimuksessa todettiin, että raaka-aineiden laatuun tulisi kiinnittää erityistä huomiota, kun valmistetaan eineksiä, joita ei kuumennuskäsitellä.
Myös tuotantolinjan rakenteelliset muutokset voivat edesauttaa elintarvikelaitosta pääsemään eroon listeriakontaminaatiosta.