Bakteerin virus mallina rotaviruksen tutkimuksessa
19.6.2006
Helsingin yliopistolla tehty tutkimus paljasti erään bakteerin viruksen eli bakteriofagin rakenteeltaan samankaltaiseksi kuin tietyt vaaralliset, ihmisiä infektoivat virukset. Isäntinään pelkästään bakteereja käyttäviä bakteriofageja tutkimalla voidaankin selvittää yleisiä viruksiin ja niiden elinkiertoon liittyviä seikkoja ilman, että tarvitsee tutkia ihmisiä infektoivia viruksia.
Suomen Akatemian Virustutkimuksen huippuyksikön rakennebiologit Juha Huiskonen ja Sarah Butcher selvittivät Phi6-nimisen bakteriofagin rakenteen yhteistyössä Euroopan molekyylibiologian laboratorion (EMBL) tutkijoiden kanssa. Sen rakenne osoittautui yllättäen hyvin samankaltaiseksi muun muassa ihmisen rotaviruksen kanssa. Rotavirus on yleisin vakavan ripulin aiheuttaja, etenkin vastasyntyneillä ja pienillä lapsilla. Kehitysmaissa ripuli on yksi yleisimmistä lasten kuolinsyistä.
Bakteriofageja tutkimalla tutkijat pystyvät selvittämään monia virusten elinkiertoon liittyviä seikkoja, joita ei voida tutkia käyttämällä vaarallisia ihmisviruksia. Suomalaistutkijoiden selvittämä bakteriofagin rakenne auttaa ymmärtämään, miten viruspartikkelit kasataan kun ne lisääntyvät isäntäsolussa. Näiden tapahtumien tutkiminen bakteriofagia käyttäen auttaa ymmärtämään vastaavia tapahtumia myös ihmisviruksissa.
Bakteriofagien ja ihmisten virusten rakenteellinen samankaltaisuus johtuu todennäköisesti yhteisestä, hyvin varhaisesta kantamuodosta. Samankaltaisuus rakennetasolla on evoluution kuluessa säilynyt, vaikka virusten geenisekvenssit ovat hyvin erilaisia.